感染症為世界上最盛行的人類及動植物疾病。舉凡愛滋病、B型肝炎、肺結核、瘧疾等仍到處肆虐。如何預防、控制及治療,是很迫切的問題,由基因體的觀點,感染症是病原體的基因體,進入人類之後,與人類基因體互相作用的結果。病原體本身的基因特性,與宿主自己的基因特性,一部分就會決定感染症的最後結局。這些例子如非洲人的鐮刀型血紅素基因型有利於對抗瘧疾;或對HIV受體不同基因型的人群對HIV感受力有別,都佐證此一論點。在病原體方面,流行性感冒病毒的基因變異與大流行的關係,為熟知的事。因此由基因體觀點切入,將成為一個新的研究途徑。而台大在感染症的臨床和基因研究上,已有深厚的基礎。比如肝炎病毒、EBV病毒以及幽門桿菌、肺結核菌等。值此之際更需要基因體的創新技術,來解決過去不能回答的問題,甚至開發新的醫學知識 ( 比如選殖出新的病原體 ),以維持並提高本校在國際學術、研究上的地位
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在人類基因體計畫( Human Genome Project )完成及人類基因之解碼後,醫學已邁入所謂的後基因體時代( post-genome era )。目前已知人類基因約只有三萬多個左右,但由這些基因所合成出來的蛋白質可能至少有數十萬個。藉由這些基因及蛋白質的調控及交互作用,人類得以控制正常的發育及生長,執行各種正常的生理作用。而疾病的產生,也緣於這些基因與蛋白質的異常。雖然目前我們已知道人類基因的序列,但大部份基因的真正功能及其與疾病的關係,則未能了解。如何利用人類基因體計畫所衍生的大量資訊,應用於醫學領域,了解疾病的發生原理及其基因之變異,進而能找出有療效的標的分子,開發新的診斷方法及治療藥物,均是目前最重要而且熱門的研究題目。研究極為複雜的疾病與基因之關係,最主要需要有正確及豐富的臨床材料,台灣大學有一流的醫學中心 --- 台大醫學院附設醫院,我們有充足及多樣化的臨床檢體及優秀的臨床醫師,配合在台灣大學醫學院及公共衛生學院既有之傑出研究,而且也已建置了 「基因體醫學研究中心」作為相關研究的核心研究平台,實在是研究基因體醫學最有利的條件。

感染症為世界上最盛行的人類疾病。舉凡愛滋病、各型肝炎、肺結核、瘧疾等仍到處肆虐,其中有些感染症如肝炎病毒、 EB 病毒、幽門桿菌等,更證實和癌症之發生有密切關係。如何預防、控制及治療,是很迫切的問題,由基因體的觀點,感染症是病原體的基因體,進入人類之後,與人類基因體相互作用的結果。病原體本身的基因特性,與宿主自己的基因特性,就會決定感染症的最後結局。由非洲人的鐮刀型血紅素基因型有利於對抗瘧疾;或對 HIV 受體不同基因型的人群對 HIV 感受力有別,都可佐證此一論點。在病原體方面,流行性感冒病毒的基因變異與大流行的關係,為熟知的事,特別是 2003 年的 SARS-Co V 病毒感染與 2004 禽流感造成全球包括台灣社會重大影響,但突顯新興感染症研究之重要性,也可預測除了目前重要的感染症之外,每年隨時都可能有更具威脅性的新感染症出現,可能影響全球,或只侷限亞洲、華人地區,甚至只有台灣。由於感染症的發生是病原體和宿主互動的結果,因此不管流行病學、致病機轉及疾病型態都因人種和地區而有不同程度的變異。而在差異中,仍然存在共通的基本機制,因此感染症的研究不但是解決國內特有感染症必需及具有先天優勢,也可能因而同時解決全球共通的問題。因此由基因體觀點切入,將成為一個新的研究領域。而台大在感染症的臨床和基因研究上,已有深厚的基礎。目前國際領先的有肝炎病毒研究,包括全球首先全面 B 型肝炎疫苗防治、首先發現 C 型肝炎的干擾素合併治療,並為全球使用, B 、 C 、 D 型肝炎分子病毒學及基因體學也在國際有一席之地。未來在藥物基因體學、基因治療等仍持續會有重要進展。國內領先的則有 SARS 病毒、幽門桿菌、克雷伯氏菌與 EB 病毒。 SARS 研究由於流行爆發晚於香港 2-3 個月,因此失去國際最早的機會。但從臨床、分子病毒學與流行病學仍為國內領先,其中 SARS 病毒基因解碼在一個月內完成,不但是國內第一也是國際一流。幽門桿菌如微生物基因功能(發現新限制系統如 DNA 轉型基因、抗藥基因、全基因表現)、胃淋巴癌及胃癌致病相關因子,均為國內第一,且部分也屬國際一流。克雷伯氏菌為全球首先證明國內特別盛行之細菌性肝膿瘍致病基因,並證實此菌基因體在不同地區不同疾病之差異性; EB 病毒則由流行病學首先證實感染和鼻咽癌之關聯,並有國內最多的分子病毒基因研究。很有潛力的領域上有引起子宮頸癌之人類 papilloma virus 、國人重要的肺結核病,如果藉由結合醫學院之臨床、生化分生、藥理及新藥研發與微生物及免疫學、公衛學院之流行病學、預防醫學與工學院之醫學工程、奈米科技、分子影像、電資學院之(生物)資訊、生科院與生技中心之尖端生物技術,將可以真正結合全校最優秀的人才,使全中心的人才都是頂尖而且投入,解決既存單一系所無法克服的良莠不齊的困難,加上基因體中心核心平台的服務,很快可以達到國際一流 .
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(I) 第一工作項目—臨床資料庫及基因庫建立
 
  • 病原體之收集及基因庫建立。
  • 感染者之臨床、血清及基因庫之建立。
  • 感染者 ( 或發病 ) 家族成員之建立。
  • (II) 第二工作項目—關鍵科技之引入及應用
     
  • 病原體之基因資料及多型性分析。 ( 微生物 SNP)
  • 病原體的泛基因體全面突變技術 ( 對病毒或細菌 ),以及基因表現。
  • 感染者的免疫反應:細胞及體液免疫基因 (Immunogenomics)
  • 感染者及家族分析—相關或連鎖分析以尋找宿主之易感或耐變 (Susceptibility 或 Resistance) 基因。
  • 感染者之藥物基因體學—宿主或病原體對治療藥物的易感受或抗藥基因,甚至不良反應的相關症狀。未來將使用Affymetrix 10K 或 100K chip 來分析。
  • 感染者對病原體之全面基因反應 (Activation program of gene expression) 。
  • 人類感染症之動物模式的系統式建立:以小鼠〝擬人化〞模式,來建立可被各種人類或感染原感染之小鼠。
  • (III) 新的臨床試驗方法及生物科技發展:對於疾病的診斷及治療均有應用的可能。
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